Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TIMM17BO60830 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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TIMM17BO60830 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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TIMM17BO60830 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TIMM17BO60830 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TIMM17BO60830 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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