Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACSL4O60488 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms