Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms