Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGSM2O43147 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms