Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SOCS1O15524 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms