Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LAMA5O15230 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms