Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD8O14715 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms