Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM38O00635 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM38O00635 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM38O00635 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms