Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC01387J3KSC0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms