Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms