Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms