Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms