Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
A8MVJ9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
A8MVJ9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A8MVJ9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A8MVJ9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
A8MVJ9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
A8MVJ9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
A8MVJ9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
A8MVJ9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms