Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A6NL46 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A6NL46 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
A6NL46 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
A6NL46 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms