Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VWA3AA6NCI4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms