Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms