Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms