Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KPTNQ9Y664 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KPTNQ9Y664 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms