Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUBP2Q9Y5Y2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms