Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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HCN4Q9Y3Q4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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HCN4Q9Y3Q4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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HCN4Q9Y3Q4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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HCN4Q9Y3Q4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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HCN4Q9Y3Q4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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