Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
POMPQ9Y244 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POMPQ9Y244 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms