Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IGSF9BQ9UPX0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms