Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETD1BQ9UPS6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETD1BQ9UPS6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms