Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMPXQ9UHP9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SMPXQ9UHP9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms