Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDRG3Q9UGV2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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