Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EHD3Q9NZN3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms