Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJC28Q9NX36 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms