Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms