Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL1Q9NSC2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL1Q9NSC2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms