Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX15Q9NRS6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms