Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB9BQ9NP90 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms