Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAB18Q9NP72 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms