Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP29Q9HBJ7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms