Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSPNQ9HAW4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSPNQ9HAW4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms