Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTNAP4Q9C0A0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms