Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NSD3Q9BZ95 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms