Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM54Q9BYV2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms