Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms