Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSPO3Q9BXY4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms