Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM43Q9BTV4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms