Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF1Q9BSM1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCGF1Q9BSM1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms