Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms