Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL4Q9BPW4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOL4Q9BPW4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms