Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EP400Q96L91 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EP400Q96L91 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms