Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ZBED3Q96IU2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ZBED3Q96IU2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ZBED3Q96IU2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ZBED3Q96IU2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZBED3Q96IU2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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