Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
STAMBPL1Q96FJ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STAMBPL1Q96FJ0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms