Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC97Q96F63 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms