Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNFT2Q96EX2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms