Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHFRQ96EP1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHFRQ96EP1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms