Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIRT1Q96EB6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms